2009年1月，国务院通过《珠江三角洲地区改革发展规划纲要（2008－2020）》，同年，国家发展改革委员会以《国家发展改革委员会关于珠江三角洲地区城际轨道交通网规划（2009年修订）的批复》对修订的珠江三角洲地区城际轨道交通网总体规划进行了批复。根据该总体规划方案，到2030年，广东省共有城际轨道线路21条，联络线3条，线网总里程2008公里，呈“三环八射”的基本构架。按照该规划测算，对城际动车组远期总需求在4000辆左右。

2009年5月，广东省政府与原中国南车集团签订战略合作协议，要进一步加强在轨道交通领域的合作，为解决珠三角城际动车组线路在运营过程中的车辆维修问题，协议中明确将在珠江三角洲地区选址建设轨道交通车辆修造基地。经双方研究决定，由省铁投集团与南车浦镇公司作为具体执行单位，合作建设轨道交通车辆修造基地。

2010年初，经专家组选址，广东南车轨道交通车辆修造基地建设项目正式落户江门市新会区。

2010年6月1日，广东南车轨道交通车辆有限公司挂牌成立。

2010年9月25日，广东南车轨道交通车辆修造基地开工仪式在江门市新会区举行。

2012年12月，广东南车一期工程新造部分全面建成，投入使用。

2013年1月13日，中国南车确定广东南车公司党委和经营班子按中国南车一级子公司班子进行管理。

2013年5月28日，广东南车公司首列CRH6型动车组顺利下线。

2014年5月24日，由广东南车自主生产的首列CRH6A型动车组顺利下线，并于2014年7月14日出厂，前往北京铁科院做型式试验。

2014年12月5日，广东南车首列地铁车辆完成组装、调试工作。

2015年7月5日，由广东南车自主生产的首列CRH6A型动车组完成型式试验，各项试验结果合格。

2015年9月29日，广东南车CRH6A城际动车组正式获得国家铁路局颁发的“CRH6A型电力动车组制造许可证”。

2015年11月22日，广东南车轨道交通车辆有限公司技术中心揭牌成立。

2015年12月4日，公司独立投标并中标“珠三角城际轨道时速200公里CRH6A型城际动车组采购招标”项目。

2015年12月17日，公司生产的CRH6A型动车组首列正式交付。

2016年2月23日，公司更名为“中车广东轨道交通车辆有限公司”。